THY, AnadoluJet, Borajet ve Pegasus Havayolları ile İstanbul Atatürk ve Sabiha Gökçen havalimanlarından Balıkesir Edremit Koca Seyit Havalimanı'na haftanın her günü 55 dakika süren aktarmasız uçuşlar bulunuyor. Havaalanından araba kiralayarak yaklaşık 1-1,5 saat süren bir yolculuk sonrasında Ayvalık'a ulaşabilirsiniz. Borajet ile uçan yolcular; Borajet'in transfer hizmetlerini kullanarak Ayvalık'a gidebilir. Ayvalık'a karayolu ile gitmek istiyorsanız, İstanbul-Ayvalık arası mesafe 517 km; İstanbul Yenikapı'dan yapacağınız 2 saatlik bir feribot yolculuğunun ardından, Bandırma üzerinden 3 saatlik bir otomobil yolculuğu ile Ayvalık'a ulaşabilirsiniz. Yaz sezonunda Haliç'ten kalkan Seabird deniz uçakları ile Ayvalık'a uçabilirsiniz.